消化道肿瘤指标主要包括甲胎蛋白、癌胚抗原、糖类抗原和胃蛋白酶抗原、糖类抗原以及鳞癌相关抗原等。甲胎蛋白是公认早期诊断和筛查原发性肝癌的特异性指标，因此它的升高应该引起高度重视，常见于活动性肝癌，个别胃癌特别是发生肝转移的患者也会发现AFP的增高，另外在先天性恶性畸胎瘤和生殖腺肿瘤的患者，AFP也明显升高。