胃肠道间质瘤是一种可以变为癌性肿瘤的疾病。一旦发现这个疾病首先要进行药物的控制，先不要吃辛辣油腻食物，可以吃些保护胃肠粘膜的药物，不要吃过度刺激的食物。这个病情一旦发现立刻要进行手术的治疗，肿瘤部位、大小、核分裂象、肿瘤术中是否完整切除、组织学类型、免疫组织化学类型、增生抗原表达、增生倍数、性别年龄、突变类型与肿瘤的预后相关，但目前无统一的预后标准。