因为鼻咽部正是颅底，所以极易颅内转移。颅神经损害以三叉神经出现颜面部疼痛、牙疼痛、外展神经一侧眼球内斜、舌咽神经痛、舌下神经舌向一侧偏斜较常见。颅底骨质破坏较常见，全身许多器官和部位都可发生转移，其中以骨脊椎、盆骨、肋骨等、肺、肝等最多，常有多处同时发生转移病变。