感染甲流后发烧应及早服用药物进行治疗，有助于控制病情进展。
甲型流行性感冒的病理机制主要是由于甲型流感病毒经由空气等媒介进入机体内，大量复制，引起炎症反应，导致组织的免疫炎症损伤，引起发热等症状。所以，甲流发热患者应及时服用可抑制病毒的药物进行治疗，如连花清瘟胶囊，该药能抑制甲型H1N1、H3N2等多种流感病毒，并抑制炎症反应，缓解症状的同时防止身体在过度炎症风暴下严重受损。连花清瘟不仅针对流感发热有效，还可治疗流感头痛、肌肉酸痛、咽干咽痛、鼻塞流涕等症状。
除服用药物外，甲流发热患者应保持室内通风凉爽，但要注意避免直接吹风，发热身痛患者应卧床休息，也可在用药同时辅以物理方式降温，如用温水擦浴或冰袋冷敷头部。