十二指肠乳头肥大有生理和病理两种情况，可以通过一般治疗、药物治疗以及手术治疗进行处理。
生理上是由于先天性的，只要不会妨碍到胆汁的排出，也没有出现腹部疼痛或者其他的表现，是可以不用进行治疗的。十二指肠乳头的炎症、肿瘤等是病理性的表现，出现腹痛、黄疸等表现后要立即就医，做好腹部CT，以及肝、胰、脾等部位的MRCP检查，以确定原因，以便进行后续的处理。可以使用消炎药物或手术进行治疗.