在解剖部位以及功能上都有很大的差别。
1.解剖部位：在喉咙的两边有一个，左边一个，右边一个，脖子下面有一个，在甲状软骨与胸骨的中间，还有一个类似于蝴蝶结的腺体，就是在气管的两边。
2.功能：扁桃腺是身体的一个重要脏器，可以产生大量的淋巴细胞，还可以产生大量的免疫抗体，可以抵御各种疾病的侵袭，可以说是身体的第一道防线。甲状腺是身体中最重要的内分泌器官，功能与功能是分泌甲状腺激素与降钙素。降钙素是一种可以调整体内的钙质含量的药物，可以通过降钙素来调整体内的钙质含量。
扁桃体与甲状腺是两个性质迥异的腺体，二者并无必然联系。