头上囊肿有效的治疗手段是选择手术。对于比较小的病变，可以在局部麻醉下进行手术切除；病变比较大，可以通过静脉麻醉或者全身麻醉。由于头皮的供养血管非常丰富，在手术当中容易出现出血，操作过程当中应该注意止血，可以选择头皮夹止血，避免出血或者血肿的发生。