肛乳头瘤早期无症状。早期无任何症状，当生长到一定程度后会随着排便脱出肛外，便后需要用手再塞回肛内，就像肛门部长了个小尾巴。有些蒂过细的肛乳头，会在大便的冲击下被拉断脱落。一般不会出血，瘤体过大，或脱出频繁，会有分泌物造成肛周潮湿或湿疹，出现瘙痒等症状。肛裂合并的肛乳头瘤会有疼痛、出血等症状。