呼吸机的副作用，主要由于长期呼吸机通气后，可使呼吸肌废用性萎缩及呼吸机相关的感染，比如呼吸机相关性肺炎，这都是由于呼吸机破坏人正常的呼吸道，引起的呼吸道防御屏障受损，从而出现肺部感染。因此要用呼吸机时，一定要慎重考虑病人当时情况，是否利大于弊，才决定是否应用呼吸机。