低密度脂蛋白胆固醇低具有一定危害性，多见于营养不良、甲状腺功能亢进症和肝硬化。
1、营养不良：通常是由于过分挑食和偏食而使身体蛋白质合成降低。若为轻度营养不良则危害较轻，多可造成轻度头晕和无力。但若是重度营养不良，可影响孩子的生长发育，或者对机体脏器的功能造成严重的影响，表现为心跳乏力、呼吸困难等不舒服的症状。
2、甲状腺功能亢进症：一般是由于体内甲状腺激素分泌过多所致，因疾病导致体内一切物质代谢过度，从而出现低密度脂蛋白胆固醇低。如治疗不当，会导致机体消瘦，突眼或引起甲亢性心脏病和甲亢危象。
3、肝硬化：通常是由于肝功能受到严重损害，导致胆固醇功能出现异常，数值较低，一般对病人的生活质量产生严重的影响，若导致肝功能衰竭及多种并发症的发生，主要有腹水，食管胃底部静脉曲张断裂出血。
在此基础上，如果病人发生恶性肿瘤时，还可能发生该值较低而危害健康。