亚急性甲状腺病因与病毒感染有关，如流感病毒、柯萨奇病毒、腺病毒和腮腺炎病毒等，可以在患者甲状腺组织中发现这些病毒，或在患者血清发现这些病毒抗体，10%~20%的病例在疾病的亚急性期发现甲状腺自身抗体，疾病缓解后这些抗体消失，推测它们可能继发于甲状腺组织破坏。从病因上看，亚甲炎主要与病毒感染有关。故需注意避免感染，注意休息，定期复查甲功。