血培养是诊断感染性心内膜炎的最重要的办法，可为抗生素的选择提供重要的参考依据。做血培养时应在应用抗菌药物前采血，这时阳性率很高，至少每间隔1小时采集不同部位的静脉血，做3次血培养。如果患者已经应用过抗生素，且病情允许，建议在停药2-7天后再采血，同样也是3次以上抽静脉血做血培养。病情危重的患者，应每隔半小时至1小时采血4到6次，然后经验性应用抗生素。