亚急性甲状腺炎的患者一般在甲亢期、甲减期会出现甲状腺疼痛的症状，甲亢期最为明显。亚急性甲状腺炎分为早期，一般指的是甲亢期，中期多指的是甲减期，最后是晚期，也就是甲状腺功能恢复正常期。一般在早期时患者的突出临床表现是甲状腺区的疼痛，疼痛可以向耳后、枕后、颈后这些部位放射。有的患者还可以出现全身感染性的症状，比如发热等这些症状，随着疾病的发展会逐渐的过渡到甲状腺功能减退期，往往到达这一时期，甲状腺炎的疼痛的症状会开始减轻。