甲亢突眼不会自愈。甲亢突眼分为良性突眼和恶性突眼，无论哪种突眼都需要药物进行治疗，没有不用药物就可以自愈的甲亢突眼。治疗甲亢突眼，首先需要纠正甲状腺的功能，如果甲亢突眼程度比较轻微，在甲亢得到控制后，3-6个月的时间内，突眼会逐渐的恢复。但是如果甲亢突眼严重的话，即使甲状腺功能恢复正常，突眼要完全恢复的可能性也比较小，使用激素或者免疫制剂积极治疗，可以适当的控制突眼症状。