目前在临床中病毒性心肌炎的临床诊断，主要依据包括有以下几点：1、发病前有胃肠道感染或呼吸道感染病史；2、心脏损害的各种临床表现，以及心肌损伤标志物阳性。3、其它辅助检查，如心脏超声、心电图提示有心肌损伤；4、病原学检查阳性等等。如果含有上述以上的主要诊断依据为阳性，则应该考虑病毒性心肌炎的可能。
如果确诊病毒性心肌炎，则需要依靠心内膜的心肌活检，当诊断明确时就要对病毒性心肌炎进行积极的治疗。目前在临床中没有特异性的治疗手段，主要针对于病毒感染和心肌炎症的治疗，要充分的休息，清淡的饮食，进食富含有蛋白质、易消化的饮食。如果病情需要，则需要进行抗病毒治疗。营养心肌的治疗包括维生素C、辅酶Q10，以及多种维生素等，严重的心肌炎则需要糖皮质激素。