孩子的室间隔缺损进行手术，可能会出现以下并发症：
1、若手术前缺损比较大(5-6mm)变成手术后小缺损(1-2mm)时，出现残余分流，小的分流也有可能会自行闭合，患儿只需要随诊观察。但当分流量大的时候，可能需要再次手术或介入封堵。
2、术后的房室传导阻滞，需要安装心脏永久起搏器，来维持心脏的正常功能。
这是心脏手术后最常见的两种并发症，但发生的几率在3%以下，所以室间隔缺损手术预后比较好，患儿在手术后就同正常儿童一样。