由于脚气病性心脏病主要是由于维生素B1缺乏所致，病因和发病机制明确，针对患者出现的神经系统及心血管系统症状对症治疗，如积极补充维生素B1，对于心衰发作的患者于积极利尿、改善心功能不全，同时患者若合并神经系统症状，应积极纠正病因、营养神经等治疗。临床中主要遵循早期、积极治疗，对患者进行疾病预防、药物治疗是临床上常见的治疗方式。
一、药物治疗
1、维生素B1：又称硫胺素，通常通过肌肉注射给药，维生素B1能够纠正病因，维持神经组织、肌肉、心脏功能。但是过量服用会导致头痛、烦躁、食欲减退，通常不与阿司匹林、氨茶碱合用。
2、其他B族维生素：如烟酸、维生素B2、维生素B6、维生素B12等，在补充维生素B1的同时，还可给予治疗量的上述B族维生素对症治疗，可以缓解B族维生素摄入不足，改善症状。
3、呋塞米：适合心力衰竭发作的患者，应用利尿剂可以减轻心脏前负荷，减轻水肿，缓解气喘、呼吸困难的症状。但是对于血压低、休克的病人要慎用，避免加重休克。同时注意监测电解质变化，避免引起低钾血症。
4、葡萄糖：维生素B1静脉滴注时，加入10%葡萄糖溶液可以增加维生素B1的疗效，同时，葡萄糖能改善机体的无氧代谢，减少乳酸、丙酮酸的堆积。糖尿病患者慎用。
二、手术治疗
该病无需手术治疗
三、其他治疗
对于已经发生严重的心力衰竭或重度呼吸困难及休克的患者，可给予吸氧、适当镇静，安静卧床休息，减少心肌耗氧量。