糖原贮积病Ⅴ型主要是因为基因突变导致，属于一种常染色体隐性遗传疾病，主要是由于染色体的PYGM基因突变引起，好发于有遗传因素的人群。
基因突变：糖原贮积病Ⅴ型患者是由于11号染色体上PYGM基因突变导致肌磷酸化酶活性明显减低或缺失，使糖原不能被水解，影响体内的糖原分解和ATP的产生，导致糖原在肌纤维内大量堆积，出现相应的症状，本病仅累及肌肉。