甲状腺功能亢进性肝病原因较为复杂，可能与机体自身免疫性破坏肝功能有关，又称自身免疫性肝病，甲状腺相关激素、肝脏能量相关代谢障碍、甲亢本身以及甲亢性心脏病有关，也可能是多种因素共同作用的结果。
一、主要病因
1、肝营养不良：甲亢患者由于代谢率增高，营养物质消耗过多，加之腹泻，营养物质吸收减少，造成肝营养物质缺乏。使糖、脂肪、蛋白质及胆色素代谢受损，从而使肝细胞变性、坏死及胆汁淤积。
2、肝相对缺氧：甲亢时，肝各种代谢活跃，耗氧量增多，但血流量并不增加，造成肝相对缺氧。此外，甲状腺激素能刺激肝细胞对氧的消耗，并对某些酶系统有直接作用，如肝内磷酸甘油激酶增多。氧供应不足，以致线粒体肿胀，肝细胞发生脂肪变性，肝细胞急性坏死，尤其是肝小叶中心区域的细胞供氧不足，造成肝小叶中央坏死，使肝大，转氨酶升高。
3、心力衰竭：甲亢性心脏病并发充血性心力衰竭时，可发生肝静脉淤血和肝小叶中央坏死。
4、甲亢时血流动力学改变：血流加速，肝动脉和门静脉之间的正常压力不易维持，肝小叶周围血窦充血扩张，甚至出血，造成肝小叶压迫性萎缩，导致黄疸、肝功能障碍。
5、肝病变：肝的病变使甲状腺激素的转化率降低，血液中甲状腺激素的增加可进一步损伤肝。并发感染、休克，可加重肝损害。
二、诱发因素
血清促甲状腺素受体抗体水平增高是诱导甲状腺功能亢进性肝病的危险因素，其作用机制可能与血清促甲状腺素受体抗体与促甲状腺激素受体结合后诱导的肝细胞炎性损伤有关。