糖原贮积病Ⅰ型为常染色体隐性遗传，系由于基因缺陷导致肝脏先天性葡萄糖-6-磷酸酶缺乏或其转运系统缺陷，糖原不分解为葡萄糖。
糖原贮积病Ⅰ型的主要病因是基因突变导致葡萄糖-6-磷酸转运蛋白(G6PT)缺乏所致。基因缺陷会导致肝脏先天性葡萄糖-6-磷酸酶缺乏或其转运系统缺陷，糖原不分解为葡萄糖。过多的糖原累积于肝脏，导致肝脏显著增大，由于6-磷酸葡萄糖增多，导致通过磷酸戊糖途径的糖酵解增强，产生过多的脂肪、乳酸及尿酸，造成高脂血症、酸中毒及高尿酸血症；由于肝脏不能释放出葡萄糖，一旦肠道停止摄入葡萄糖，立即发生低血糖；由于糖原不能利用，促使蛋白质、脂肪分解代谢增强，影响患儿生长发育。