新生儿房室传导阻滞的治疗应根据患者的病情程度，采取相应的治疗措施，轻度的房室传导阻滞一般无需治疗，重度的房室传导阻滞需要长期进行相关治疗，主要包括去除诱因、积极治疗原发病，还需应用阿托品、异丙肾上腺素、氢化可的松等药物进行治疗和人工起搏治疗等。
一、一般治疗
1、去除诱因：了解存在的诱因并及时消除，如停服洋地黄、奎尼丁、氯喹、普鲁卡因等等。
2、原发病的治疗：如有先天性心脏病或病毒性心肌炎，应积极治疗，避免发生房室传导阻滞。
二、药物治疗
1、阿托品：是一种受体激动剂，能提高心室率，加快传导。治疗原则是早期、足量、联合、重复用药。根据有无异常分泌、体温及脉搏调整阿托品用量，直到临床症状明显好转或出现阿托品化。
2、异丙肾上腺素：有强大的心脏β受体兴奋作用，使心肌收缩力增强、心率加快和传导加速，与肾上腺素比较，对起搏点的作用更强，不易诱发心律失常。
3、氢化可的松：针对感染性或病毒性心肌炎，可用氢化可的松静脉滴注，以消除传导神经的炎症反应，促进传导的速度。
三、手术治疗
人工起搏治疗：如果患者症状较重，药物治疗效果不佳时，应考虑采用心脏起搏。传导阻滞导致血液动力学障碍，引起有症状的心动过缓且病因不可逆者，应给予永久性起搏治疗。