1、体格检查：主要为心脏听诊一般可闻及心脏杂音，急性者更易出现杂音强度和性质的变化，或出现新的杂音。瓣膜损害所致者主要为关闭不全的杂音，多见于主动脉瓣关闭不全。
2、血培养检查：大多数感染性心内膜炎患者存在菌血症，故而阳性血培养是诊断本病的最直接的证据。
3、血常规检查：亚急性者正常色素型正常细胞性贫血较常见，白细胞计数正常或轻度升高，急性者白细胞计数增高和明显核左移，红细胞沉降率几乎均增高。
4、心脏CT检查：在显示瓣膜旁解剖结构和并发症方面的效果较好，而且受人工瓣膜伪影的影响较少。
5、超声心动图检查：不仅可探得瓣膜上的赘生物，能探测到赘生物所在部位、大小、数目和形态，还可见包括瓣叶结节样增厚、瓣叶穿孔、粘连、室间隔或瓣环脓肿、主动脉瓣细菌性动脉瘤和心包积液等其他异常。
6、X线检查：无特异性，仅能发现间接征象，如肺部多处小片状浸润阴影提示脓毒性肺栓塞所致肺炎。左心衰竭时，有肺淤血或肺水肿征，主动脉细菌性动脉瘤可致主动脉增宽。
7、心电图检查：缺乏特异性，当并发室间隔脓肿时，可出现不同程度房室传导阻滞。此外，可能发现各种心律失常和房室肥大、劳损的心电图改变。还要观察有无ST-T缺血的改变。
8、血清免疫学检查：可明确免疫功能应急及炎症反应。