多数新生儿扩张心肌病病例病因仍不清楚，可能与遗传、中毒、代谢（如肉毒碱缺乏）及营养障碍（如硒缺乏）等因素有关。本病多发生在有心肌疾病家族史的患者中。
1、遗传：25%~50%扩张型心肌病病例有基因突变或家族遗传背景，遗传方式主要是染色体显性遗传。
2、中毒：化疗药物和某些心机毒性药物和化学品，如阿霉素等蒽环类抗癌药物。某些维生素和微量元素如硒的缺乏也能导致扩张型心肌病。
3、感染：病毒性心肌炎被认为与本病关系密切。