肥厚型心肌病是特发性心肌病的一种，目前没有根治的办法，只能缓解症状、预防并发症，改善预后。常用的药物有β受体阻滞剂，包括心得安、美托洛尔、比索洛尔，可以减缓心室率；还有钙离子拮抗剂，包括异搏定等，也可以应用利尿剂及扩血管药治疗心衰，到疾病后期会出现房颤等心律失常，就要应用胺碘酮，抗凝药治疗。对药物治疗无效的患者，可以采取室间隔肌切除术治疗。