甲功能三项一般指游离三碘甲状腺原氨酸（FT3）、游离四碘甲状腺原氨酸（FT4）、促甲状腺激素（TSH），其中前面两项由甲状腺合成和分泌，TSH由脑垂体细胞分泌。同时一般查甲功的时候还要查一下这些抗体：甲状腺球蛋白抗体（TgAb）、甲状腺过氧化物酶抗体（TPOAb）、甲状腺受体抗体（TRAb）；一般甲亢表现为FT3、FT4、TRAb升高，TSH降低，一般有TgAb、TPOAb轻度升高，如果二者升高明显则可能是桥本甲亢；甲减表现为FT3、FT4降低，TSH升高，一般TgAb、TPOAb升高；如果甲功正常（FT4、FT3、TSH正常），只有TgAb、TPOAb升高，是自身免疫性甲状腺炎，将来有可能出现甲功异常。