心内膜炎可能导致很多并发症，如充血性心力衰竭以及产生心肌的脓肿，甚至导致急性的传导阻滞，还有的导致心肌梗死，以及化脓性心包炎，以及心肌炎等并发症，有的还有可能导致脓肿的转移，以及细菌性动脉瘤的产生。心内膜炎对于神经系统也有一定的危害，如引起脑栓塞、脑细菌性动脉瘤，以及导致脑出血等。细菌性心内膜炎的患者，应该及时使用抗菌药物，要预防心膜炎的并发症。