纳豆激酶的一个显著功能便是具有溶解血栓的作用，可激活体内的纤维蛋白溶酶原，从而使内源性纤溶酶的量有所增加。健康人口服纳豆激酶之后，出现以下效果，可以明显地缩短了尤球蛋白的溶解时间，血浆中的纤溶活性提高，血浆中t-PA量有所增加。由于NK的安全性，稳定性和良好的溶解血栓的作用，其有可能作为口服试剂用于血栓治疗。