如果不经过手术治疗，自然预期寿命非常短，总死亡率能够超过60%。其中50%均在出生后一个月内死亡，74%在出生半年内分型的不同导致了死亡率的不同：50%的A型单心室的平均在14岁之内死亡；而50%的C型单心室在死亡。所以如果能够早期发现，应该积极早期手术治疗。