治疗方法包括：姑息手术仅能起到缓和症状的作用而不能起到效果。心脏移植用于终末性心脏病及无法用手术方法治疗的复杂先心病。介入治疗部分代替但还不能替代外科手术开胸手术且有严格的适应证。球囊扩张法解除血管及瓣膜的狭窄，如主动脉瓣狭窄、肺动脉瓣狭窄、主动脉缩窄等。利用特质封堵器堵闭不应有的缺损，如房间隔缺损、室间隔缺损、动脉导管末未闭等。