新生儿甲减的治疗原则是早期诊断、足量治疗。甲状腺激素治疗启动得越早越好，必须在产后4-6周内开始。治疗药物选择L-T4。L-T4起始剂量10-15ug/kg.d。治疗目标是使血清TT4水平尽快达到正常范围，并且维持在新生儿正常值的上1/3范围即129-206nmol/L。