抗甲状腺过氧化物酶抗体为自身免疫损伤的标志物，也是诊断甲状腺自身免疫性疾病的首选指标。若其有所增高，则代表着体内存在自身免疫的破坏。若在升高的同时，出现促甲状腺素下降，血清游离T3、T4升高，表示合并甲亢，此时应接受抗甲亢药物治疗。