引起甲低的原因大致分为四大类，原发性甲减、继发性甲减、消耗性的甲减和甲状腺抵抗综合征。其中的原发性甲减占四大类病因中的百分之九十九，常见原因是自身免疫性的甲状腺炎、碘131的治疗后或甲状腺手术后，继发性甲减的原因是下丘脑或垂体的疾病。