亚临床甲减引起先天因素：甲状腺发育异常、甲状腺激素合成障碍等；后天因素：桥本甲状腺炎、抗甲状腺药物的治疗、亚急性甲状腺炎等；医源性甲状腺炎：甲亢经抗甲状腺药物治疗、甲状腺切除术后、甲状腺放射碘治疗后等，医源性因素是亚临床甲减第二类常见原因。