病人发生复发性口腔溃疡其原因较为复杂，至今均未完全清楚其发病原因。
但往往认为这是由多因素、共同作用所致，即复发性口腔溃疡为多因素疾病。很可能由遗传基因和免疫功能异常及社会环境因素三块因素综合造成。当然病人的精神压力太大、病人长期吸烟、病人口腔卫生差、病人饮食不均等也都是可以造成的。
建议在日常注意口腔护理，定期刷牙，减少口腔溃疡的发生。