口腔临床上最常用的抗生素分别是硝基咪唑类抗生素和头孢菌素类抗生素。硝基咪唑类抗生素只针对厌氧菌感染。包括甲硝唑、替硝唑和奥硝唑，分别是一代、二代和三代药物。三代和二代药物比前一代的药物不良反应要更小，疗效更好。此类药物对胃有刺激，最好饭后服用。头孢菌素类抗生素是目前广泛使用的一种抗生素。