舌头根部痛可能是由于扁桃体发炎而引起的，或者与心火旺盛有一定的关系，注意不要暴饮暴食，不要吃刺激性的食物。或者微量元素或者是维生素缺乏而引起的，可以服用葡萄糖酸锌或者是维生素B，多吃水果蔬菜。或者咽喉感染引起的，比如慢性咽炎或者是咽部淋巴滤泡发炎。