牙周炎治疗分为四个阶段，首先是基础治疗阶段，清除、控制炎症和咬致病，包括口腔自洁，龈上洁治，龈下刮治以清除菌斑、牙石，选用抗菌药控制炎症，咬颌调整等。其次是牙周手术治疗和松动牙固定。第三个阶段是永久性修复治疗，通常手术后2到3个月后进行。第四阶段是复查阶段，每半年一次，包括检查菌斑，拍片检查，以进一步拟订治疗计划。