舌头根一侧疼吞咽都疼可以用药物治疗或者是改变饮食习惯，如果说是智齿发炎是需要就诊冲洗，必要时是要口服消炎药的。舌头根部疼痛考虑可能是有轮廓乳头炎症，它是位于舌根部的V字型的一排舌乳头，如果说是有刺激形成的时候，它会出现肿大疼痛。