大部分是由口腔局部因素引起。因为口腔内的温度，湿度有利于各种细菌的繁殖，特别是在牙周袋内，滋生了大量的厌氧菌和幽门螺旋菌，这些细菌在生长繁殖中产生了大量的代谢产物，这些代谢产物中含有内毒素和外毒素以及硫化氢气体，从而引起口臭。还有部分口臭的原因与其它疾病有关，例如萎缩性胃炎，引起消化性不良，产生食臭味。严重的肺病如肺脓痒，重症糖尿病，重症肝病等都会引起口臭。