引起唇腭裂的原因当属遗传因素，从遗传方面来讲，有兔唇，也就是唇裂的患者，在其直系亲属或者旁系亲属中是能发现类似畸形的发生的，这就是说它与遗传相关的原因，有遗传学研究认为唇裂属于多基因遗传性疾病。从环境方面来考虑，在妊娠的前三个月中，当母体的生理状态受到侵袭或干扰时，是可能影响到胚胎颌面部的生长发育的，比如准妈妈缺乏营养，不忌烟酒，或者受到一些物理损伤等，都可能造成影响。