甲状腺滤泡囊肿治疗的方法有很多，有的通过中药治疗，还可以进行手术治疗。如果甲状腺滤泡囊肿较小，暂时无需治疗，定期复查即可。如果囊肿较大病情较为严重，就需要到正规医院进一步检查，进行手术治疗，将病变的囊肿切除，因为甲状腺滤泡囊肿是液体囊肿，所以也有通过细针穿刺抽液治疗，但有一定的复发可能。