新型冠状病毒感染可发生腹泻，有时就是吃了某些抗病毒药物，也有可能导致腹泻症状出现，需针对各种原因，采用不同处理方案。比如，如果患者患有严重肠道疾病，如慢性结肠炎等，可以停用某些药物或停止使用这些药物。如新型冠状病毒对人体的侵害，引起人体炎症反应而发生腹泻，可予抗病毒治疗；如用药引起腹泻等，这些药可以中止。腹泻严重时则要考虑是否有其疾病的影响或合并用药等问题。
此外，腹泻如果严重，需要予以补液治疗，以免出现脱水症状。