乙型肝炎E抗体是人体在HBeAg的刺激下所形成的一种对应的免疫反应，与HBc同样不具有任何防护效果。
以往人们都以为，HBe抗体阳性意味着没有HBV存在，没有传染性，是一个很好的预后指标。但有一些病人的HBe抗体阳性，由于HBV的基因发生了突变，不能产生HBeAg，因此HBeAg的病人的血液中不会产生HBeAg，因此，即使没有HBeAg,HBeAg也会继续繁殖。HBeAb的表达呈上升趋势，说明乙肝病毒在大部分病人中的传播持续了7-27年。