肝脓肿多为真菌或细菌感染所致，此外溶组织中阿米巴原虫可能存在，存在危及生命的危险，必须及时治疗，可因腹腔内有感染累及肝脏所致，可做些CT检查及B超检查确诊，再经抗生素治疗及手术切开引流完全痊愈。
肝脓肿除了需要针对病症治疗外，因为肝脏功能可能会受到影响，所以还可以采取部分保肝治疗。治疗期间戒烟戒酒，饮食清淡。