由于轮状病毒在环境中比较稳定，不容易自然灭亡。因此，婴幼儿的感染率较低，但其发病机理仍未完全阐明。
轮状病毒可以在生活接触中传播。所以，婴儿和儿童是最容易感染这种疾病的人群。新生儿轮状病毒感染多来自孕产妇的感染，产道和医院内感染。其中以母婴垂直传播为主。在医院中，轮状病毒感染可以由护理人员引起扩散。母婴垂直传播是引起婴儿急性腹泻的重要因素之一。传播方式以粪口和口口为主，亦可经水源传播，经呼吸道传播。