病毒感染导致器官衰竭，治疗效果关系到患者的特定体质，若病人普遍状况良好，大约7~14天能痊愈，如条件普遍较差，可以发生多器官衰竭，最后造成病人死亡。病毒感染可以造成严重并发症，如肺栓塞、脑梗塞等。病毒感染者需抗病毒治疗，若由甲型流感病毒引起脓毒血症，有必要使用对甲型流感有良好疗效的抗病毒药物，如奥司他韦。
另外还要加强护理工作，包括饮食和起居等方面。同时，重视对病人生命体征的监测，保持内环境的稳定。