慢性肝炎肝区一般不会疼痛，但是部分患者会出现上腹部疼痛的症状。
在慢性病毒性肝炎中，会有上腹部的持续性的隐痛，也有可能是比较强烈的阵发性的疼痛，这种情况可能是因为肝包膜的牵张，肝脏周围的炎症，或是胆道的抽搐所造成的，而慢性的病毒性肝炎则是与长期的肝胆管感染相结合的。
如果是慢性肝胆管感染，很难被误判为慢性病毒性肝炎，也可能会出现两种情况，这就说明了慢性病毒肝炎与慢性胆囊炎之间的区别，前者一般与饮食无关，其次是肝脏部位的压迫，而后者则是因为吃了太多的油腻食品引起的痛苦。