诊断甲型肝炎时，应先查病毒学指标。
一般是建议进行抗甲肝病毒IGM试验，起病约1周后血清可测得，它的发生符合临床症状和生化指标异常发生的时机。第2周达峰值，一般持续八周，少数病人可达半年或更长时间，但也有个别病人在发病初期为阴性，2~3周后才可检测到阳性，因此，临床疑为甲型肝炎病毒IGM阴性者应反复检查1~2次，避免漏诊，目前，他对甲型肝炎具有高度特异性的早期诊断标志，并有简单快捷等优点。
还可以进行抗甲肝病毒IGA试验，IGA型抗体也称分泌型抗体，主要分布在泪眼、唾液、尿液、胃液、组织中，鼻腔分泌物，胃液内IGA可向粪便排泄，甲型肝炎病人粪便提取液可测定，抗HAV-IgA是甲型肝炎辅助诊断方法之一。