如果是在乙肝病毒DNA转阴性之后，患者一般不能擅自停药，以免影响病情的控制。
目前对乙肝的抗病毒治疗主要是采用高效力、低耐药性的抗病毒药物，大多数病人服用3-6个月之后，会发现HBVDNA会发生转阴性，但是如果停药，可能会引起HBV的再次发作，也有少部分病人会有严重的肝炎症状，在医生的建议下进行治疗和停药。目前慢性乙型肝炎可以服用4年或更多的抗病毒药物，长期服用可以降低复发，少数病人推荐终生服用。