乙肝大三阳肝区疼痛主要原因是肝脏病变引起的，肝细胞的坏死和脂肪变形，肝脏的充血、渗出、肿胀等造成肝脏表面的包膜被撑紧，包膜上分布有感觉神经，此时乙肝大三阳会产生疼痛的感觉。肝区疼痛往往是乙肝大三阳病情恶化的征兆，此时千万不要掉以轻心。但有时候乙肝大三阳肝区疼痛也可能有别的原因，肝脏和胆囊是相连的，也就是说当胆道出现病变，诸如胆囊炎、胆结石等，肝脏也会出现疼痛的感觉。